Der Geschäftsbereich II der Betriebsstelle Süd des NLWKN ist zuständig für die Planung und den Bau wasserwirtschaftlicher Anlagen und Gewässer. Dabei werden insbesondere Projekte in den Bereichen Hochwasserschutz und Fließgewässerentwicklung koordiniert, geplant und baulich umgesetzt. Bei den Maßnahmen handelt es sich primär um landeseigene Maßnahmen. Ergänzend werden Projekte im Auftrage von Dritten, wie z.B. Wasser- und Bodenverbänden, übernommen.